WinCELL - це система аналізу зображень, спеціально розроблена для аналізу клітин дерев, яка дозволяє кількісно оцінювати зміни в структурі дерев на річних колесах.
Анатомічний клітинний аналіз дерев може бути проведений за допомогою рентгенівських променів для аналізу щільності дерев (наприклад, WinDENDRO). Щільність, колір, механічні та хімічні властивості дерева впливають на структуру колеса дерева, яка, в свою чергу, пов'язана з екологічним кліматом. Якість деревини може бути оцінена за допомогою вимірювання розмірів, розподілу та співвідношення радіаційних клітин до внутрішніх стін.
Використовуючи мікроскоп, WinCELL отримує зразок деревини, вироблений машиною для різання тонких шматків, або, для великих клітин, таких як катетри листяних рослин, може отримати зразок безпосередньо з деревинної поверхні* для вимірювання форми клітин дерев. Морфологічні дані дерев'яних клітин можуть бути використані за допомогою партнерського програмного забезпечення XLCell для швидкої обробки та візуалізації даних для вимірювання кожного річного колеса на одному або декількох зображеннях кожного колеса.
Зазвичай аналітики зображень не здійснюють спеціальних вимірювань дерев'яних клітин, і зазвичай дані, отримані вимірюванням, не підходять для досліджень хронології дерев. Ці системи не мають знань про формування річних колес дерев і їх клітинну структуру (наприклад, обчислення ширини колес дерев), тому жодна з них не знає, як проводити вимірювання в цій області. WinCELL знає, як це зробити, наприклад, стінки клітин між двома сусідніми клітинами повинні бути розділені на дві частини, щоб обчислити довжину клітини та ширину пружини або колеса дерева, а її загальні налаштування можуть бути використані для аналізу різних типів дерев (радіологічне розташування катетрів листяних рослин та иглолоїдних трубоцитів). Він підтримує повністю автоматичний та інтерактивний режим аналізу, який дозволяє користувачеві вибрати ряд клітин для аналізу, що імітує традиційні методи трубоцитів **. WinCELL може обробляти неповні клітини, які видаляються межами зображення, тому вони не впливають на середні вимірювання клітин.
* Використовуйте відповідні пристрої для захоплення зображень та підготовку зразків.
** Диаграма кривих розмірів радіаційних клітин у різних функціональних положеннях в річному колі.
Захоплення зображення
Високоякісні цифрові камери, розроблені в останні роки, зробили анатомічний аналіз клітин дерев простішим, ніж будь-коли раніше.
Підготовка зразків
Аналіз дерев'яних клітин зазвичай здійснюється за допомогою різання зразка дерев'я, виробленого мікроскопом за допомогою різання. Іноді підвищується контраст внутрішньої порожнини шляхом фарбування. При належній підготовці та освітленні великі катери можуть бути аналізовані безпосередньо з дерев'яної поверхні.
Мікроскоп
Для того, щоб отримати зображення різких дерев'яних зразків, отриманих мікроскопом за допомогою різких різких машин, потрібен мікроскоп з аксесуаром для встановлення камери та адаптером для встановлення C (наданим виробником мікроскопа).
Камера
WinCELL може аналізувати зображення, захоплені цифровою або аналоговою камерою. Моделі, що продаються компанією Regent, є науково-дослідними і мають стандартні C-розміщення, які можуть бути встановлені на мікроскоп. Ми продаємо три моделі камер від 1 до 6 мегапікселів (мегапікселів), які можуть бути встановлені безпосередньо над дерев'яними шматками (з оптичними лінзами). Поверхня зразка добре підготовлена, і WinCELL також може отримувати зображення з оптичного сканера (запитайте умови перед покупкою) для аналізу великих клітин (катетрів). Камери, що продаються компанією Regent, можуть бути підключені до комп'ютера за допомогою інтерфейсу Fire Cable (IEEE-1394) або USB2.0. WinCELL є продуктом, сумісним з TWAIN, що означає, що він може отримувати зображення з багатьох різних камер і сканерів.

відWinCELLОтримані зображення
Коли користувач налаштує позицію мікроскопа або зразка, просто натисніть на іконку в вікні програмного забезпечення WinCELL, щоб відображати зображення в режимі реального часу (або напівреального часу, залежно від типу камери) на дисплеї комп'ютера. Після відображення зображення користувач також може встановити параметри зображення (розмір, колір, фільтр). Щоб оцифрувати та аналізувати зображення, просто натисніть кнопку у вікні інтерфейсу камери.
WinCELLКомпозиція всієї системи:
Y Стандартна або покращена версія програмного забезпечення WinCELL з кольоровими інструкціями.
Y Сірий або кольоровий "вогневий кабель" або USB 2.0 камера з роздільною здатністю 3 або 5 мегапікселів, 2 м підключення кабелю.
Партнерське програмне забезпечення для аналізу та візуалізації даних XLCell.
Безкоштовна технічна підтримка по електронній пошті до 2 років після припинення роботи продукту.
Система Y не включає: адаптери C-встановлення для камери, які повинні бути надані виробником мікроскопу; Об'єктив камери (камера на мікроскопі не потребує об'єктива, але необхідний для інших застосувань без використання мікроскопа).
WinCELLКамера і опції:
Y цифрова камера "Fire Wire", роздільна здатність 3 або 5 мільйонів пікселів, 2 м з'єднаний кабель.
Y "Fire Wire" карта, встановлена на слот PCI ПК без з'єднання "Fire Wire"
Необов'язково:
Y кабель "Вогонний кабель" 5 метрів.
Великі лінзи Y, які можуть бути використані для інших застосувань, таких як вимірювання площі листя.
WinCELLВимірювання
Можливість виконання клітинних морфологічних вимірювань різними способами: автоматичним, напівавтоматичним або ручним (інтерактивним)
Аналіз області
Першим кроком до аналізу зразка є вибір області аналізу. Всі версії можуть аналізувати лише ціле зображення, в той час як розширені версії можуть аналізувати області будь-якої форми. У прикладі правого малюнка створена область аналізу (внутрішня частина зеленої лінії) для аналізу тільки пружинних катетрів, які належать до певного річного колеса. Ці області можна легко вибрати, малюючи контур на зображенні. Інструкція дозволяє швидко і легко створювати прямокутні та круглі області аналізу.
Внутрішня та зовнішня стіна
Площа внутрішньої порожнини вимірюється автоматично і є реальною вимірюваною площею (на основі кількості пікселів, що містяться в ній), а не оцінюється за діаметром. Внутрішні порожнини на основі їх площі можуть бути розділені на групи клітин і катетрів, ті, які більші, ніж вказані значення, класифікуються до катетрів, а ті, які менші, ніж вказані значення, класифікуються до клітин, і обидві групи можуть бути аналізовані окремо (можна отримати як загальні, так і індивідуальні дані). Користувачі можуть просто перекласувати, натиснувши клавішу і натиснувши ціль. Площа зовнішньої стіни обчислюється автоматично шляхом обчислення площі піксельного рівня в області аналізу, яка належить до зовнішньої стіни.
Площа внутрішньої і зовнішньої стінки використовується для загального значення аналізованої області (одиниця вимірювання та відсоток від площі аналізованої області), а площа внутрішньої порожнини також використовується як окрема клітина або катератор на основі окремих аналізних даних.
Функція кольору внутрішньої порожнини
Окрім площі клітин та зовнішніх стін, розширена версія також може використовувати кольорову функцію для вимірювання внутрішньої порожнини та зовнішніх стін всього аналізного регіону або частини регіону (кожна клітина).
Довжина і ширина труб
Довжина і ширина труб (або радіальний і вертикальний діаметри) можуть бути розраховані різними способами.
Максимальна довжина і ширина |
Вертикальні та радіальні діаметри |


Максимальна довжина і ширина:
Довжина трубки, розрахована за допомогою цього методу, є відстаню між двома найвіддаленішими точками внутрішньої порожнини клітини. Це максимальна довжина клітини, вимірювана в будь-якому напрямку. Ширина - найбільша відстань у вертикальному напрямку від довжини.

Вертикальний і радіальний діаметри:
Довжина вимірюється прямим радіальним вимірюванням, а ширина - прямим вертикальним вимірюванням (і навпаки). Метод пропонує три режими зміни (вони відрізняються розташуванням та довжиною вимірювання).
Довжина і ширина трубки можуть бути середніми значеннями в цілому вимірювальному регіоні або значеннями для окремих клітин або катетрів.
Положення клітин
На зображенні можна виміряти центральне положення клітини, яке пов'язано з початком річного колеса. Останнє може бути використано для статистичного розрахунку розподілу клітинних структурних параметрів функціонального положення на річному колесі.
Кількість трубоцитів (клітин і катетрів)
Клітини та катетри в аналізованій області або на шляху сліду можуть бути автоматично підраховані.
Автоматичні та інтерактивні вимірювання
Морфологічні вимірювання, згадані вище, можуть бути розраховані автоматично по всій області аналізу або за допомогою інтерактивних вимірювань вибраних клітин. У автоматичному режимі все, що потрібно зробити, це натиснути на зображення або вказати область аналізу та клітини, що містяться в аналізованій області. Інтерактивно користувач просто намалює лінію, яка проходить через клітину для вимірювання. Останнє, як правило, використовується для аналізу радіальних рядів клітин (розташування клітин, пов'язаних з розташуванням кордону річного колеса, добре відоме).
Інтерактивний режим вимірювання4Параметри типу
У повністю ручному режимі зображення не аналізується автоматично. Ця модель використовується для вимірювання будь-якого об'єкта, який рукою просто натискає на кінець. Він може бути використаний для вимірювання довжини клітини або для опису повної довжини волокна. Плоский об'єкт можна виміряти, клацнувши двічі на його кінець, а вигнутий об'єкт можна виміряти, клацнувши мишею додатково на точку деформації його кривості. Додатковий ручний режим використовується для вимірювання довжини та ширини об'єкта в парах (площа може бути оцінена пізніше), а також для вимірювання клітин, коли контраст не відповідає вимогам автоматичного аналізу.
Два напівавтоматичні режими вимірювання можуть бути використані для вимірювання довжини клітини та товщини двох сусідніх стін (по протилежній стороні внутрішньої порожнини). Одна схема відбувається в напрямку лінії слідів, а інша - в радіологічному напрямку.
Ці два напівавтоматичні методи вимірювання також дозволяють визначити довжину рядів радіоактивних клітин (між лінією розділу річного колеса та шириною колеса).

Особливості WinCell | |
|
Розширена версія: можливість аналізу областей будь-якої форми. Прямокутні та круглі області можуть бути заздалегідь визначені, а користувачі також можуть використовувати інструменти для створення будь-яких нерегулярних форм. Після створення зони можна змінити розмір, а результати аналізу автоматично змінюються відповідно.
Области можуть бути використані для аналізу різних частин зображення, розділених (наприклад, пружина праворуч). |
|
|
WinCELL використовує концепцію аналізу областей для відмови від неповних клітин. Клітини, що знаходяться поблизу краю зображення або за межами зони аналізу, можуть бути не враховані при розрахунку середніх вимірювань клітин (площа, довжина та ширина). Кольори можуть бути використані для вказування класифікації клітин (розрізані краями зображення, частково або повністю всередині або поза аналізною зоною, покинуті оператором, роздроблені, типи клітин між клітинами або катетрами). |
|
Дані вимірювань під час вимірювань є інтерактивними, а файли в текстовому форматі можуть бути прочитані багатьма програмними забезпеченнями. Ці файли можуть бути легко відкриті програмою електронних таблиць, такою як Microsoft Excel. Користувач також може натиснути на клітину, щоб показати її морфологічні вимірювання. Колонка розподілу клітин може бути побачена під час аналізу або після обробки програми XLCell, і вона також може показати загальний погляд на параметри клітинної структури. |
Колонка розподілу клітин показує кількість клітин різної площі, довжини та ширини. Для розширеної версії є функціональна область кольору.
|
Редагування зображення може компенсувати дефекти або поганий контраст (наприклад, внутрішня порожнина літніх клітин часто темна) |
Зображення можна редагувати будь-яким кольором. Можна легко вибрати колір, який відображається на зображенні, і редагувати його. Редагування зазвичай можна зробити за допомогою інструментальної ручки (яка використовується для малювання ліній) та інструментальної накладки (яка використовується для визначення контуру області). |
Розширена версія: дефекти або області, які не бажають бути проаналізовані, можуть бути виключені за допомогою області виключення або редагування зображення, області виключення можуть бути будь-якою формою. |
|
WinCELL може аналізувати сірі або кольорові зображення (обидві наші камери можуть генерувати зображення). Розширена версія дозволяє проводити більше аналізу на кольорових зображеннях. Він може відображати та аналізувати один з трьох кольорових каналів кольорового зображення, використовуючи кольори для кращої класифікації пікселів у внутрішній та зовнішній порожнині або в області кількісної оцінки кольору. | |
Вбудована програма перевірки, яка легко виконується з цілями виробника мікроскопа, підтримує різні режими цілей. | |
Фрагменти можуть бути автоматично фільтровані за розмірами або оброблені вручну шляхом редагування зображення. | |
Оригінальні зображення, отримані WinCELL, незалежно від того, проаналізовані чи ні, можуть зберігатися як стандартні файли tiff або bmp, які можуть бути використані в інших додатках (MS Word, Photoshop тощо). | |
Пакетна обробка дозволяє аналізувати ряд зображень без нагляду оператора. Аналіз може бути виконаний лише в автоматичному режимі (неінтерактивному). | |
Параметри аналізу можна зберігати в профілі для використання в подальших або повторних діях. | |
Користувачі можуть вибрати типи даних, які зберігаються. | |
WinCELL також може використовуватися як звичайний площевимірювач (наприклад, вимірювання площі листя), а після зміни деяких налаштувань за замовчуванням може використовуватися як пристрій для морфологічного аналізу інших об'єктів. | |
При придбанні системи WinDENDRO програмне забезпечення WinCELL Standard Edition надається безкоштовно. | |
WinCell регулярно оновлюється. | |
Місце походження: Канада






